仁寿二年（602）8月，独孤皇后病逝于永安宫。作为杨坚爱侣、亲人、独一知己和精力支柱的孤傲皇后的归天标记取杨坚大展雄图期间的结束，杨坚落空爱侣和精力支柱，哀思不已。据史记录对于孤傲皇后的病逝杨坚始终“不能健忘”，瞻仰“魂其有知，地下相会”。杨坚乃至下诏让当朝的第一宰相杨素放下政务为皇后寻觅陵寝之地，随后他亲临出殡，把老婆送到了安眠之地。杨坚为孤傲皇后做佛事时情不自禁的泪流满面，把为爱妻祷告阴福的禅定寺修成天下范围最大的寺院，“好像天苑举国莫有”，乃至不忍去仁寿宫触景伤情。

而后的《通历》：上有疾，于仁寿殿与百僚辞诀，并握手虚欠欷。是时唯太子及陈宣华夫人侍疾，太子无礼，宣华诉之。帝怒曰:“死狗，那可付后事!”遽令召勇，杨素秘不宣，乃屏摆布，令张衡入拉帝，血溅屏风，冤痛之声闻于外，崩。

但是杨坚的死因在分歧汗青记录中有着分歧的描述，乃至有了一桩千古奇案――“仁寿宫变”。这仁寿宫变一案的关头在于杨坚是不是被当时的太子杨广所杀，在千百年来大家几近都更情愿信赖杨广是弑君即位的。汗青的本相没法晓得，但是从那恍惚的汗青条记里还是能够找到本相的影子。

此中《大业略记》是最开端思疑并直言杨广害死杨坚的，曰：高祖在仁寿宫，病甚,追帝侍疾，而高祖美人尤嬖幸者，唯陈、蔡二人罢了。帝乃召蔡于别室，既还，面伤而发乱，高祖问之，蔡泣曰:“皇太子为非礼。”高祖大怒，啮指出血，召兵部尚书柳述、黄门侍郎元岩等令发诏追庶人勇,即令废立。帝事迫，召左仆射杨素、左庶子张衡进毒药。帝简骁健官奴三十人皆服妇人之服，衣下置仗，立于门巷之间，觉得之卫。素等既入，而高祖暴崩。……十八日，发丧。