孙承宗回到běi ī，即向熹宗明白阐述了其死守宁远，以与觉华dao守军互为犄角、遥相照应的计谋打算，正式提出了“以辽人守辽土，以辽土养辽人”的计谋目标，并建议消弭王在晋的兵部尚书及辽东经略之职。熹宗接管了孙承宗的定见，将王在晋调任南京兵部尚书。自此，里铺筑城之议遂息。

宦海沉浮

年（万历四十七年）岁升任左坊左谕德兼翰林院侍读。杨镐四路丧师，遭萨尔浒之败。明与后金计谋情势逆转。六月，明任命熊廷弼经略辽东。

年（万历三十年）4岁主持会试，取钱谦益、傅宗龙、陶崇道、王象、包鸿逵等为进士。

年（万历二十年）岁到易州为房守士课授后辈。三月，次子孙鉁出世。

年（万历二十一年）岁被选入京师国子监就学。

为了听取各方面的定见，孙承宗调集将吏会商如何戍守。监军阎鸣泰主守觉华dao（辽宁兴城东三十里海中，今称菊花dao），袁崇焕主守宁远卫（今辽宁兴城），王在晋则主守中前所（今辽宁绥中县前所）。监司邢慎言、张应吾等拥戴王在晋的定见。孙承宗在全面考虑了各方定见，衡量利弊得失后，表示支撑袁崇焕主守宁远的定见。

年（万历四十六年）岁三哥孙敬宗病逝，告假回籍治丧，后帮手县令杜应芳管理高ya水患。十一月，原配王夫人去世。努尔哈赤以“七大恨”告天，起兵反明，霸占抚顺。明起用杨镐经略辽东。

年（天启五年）岁发十二车营出关外，分为四镇，驻守锦州、右屯。承宗积劳成疾，卧病关上，朝复兴简汰之议，承宗ī简官兵一万多名，省用度五十六万。杨涟、左光斗等六君子被害。月，杀熊廷弼，传首九边。玄月，有“柳河之败”，朝中群小连章弹劾，承宗上奏乞休归里养病。十月，获准回籍，告别关门。朝廷以高第为辽东经略。

年（崇祯元年）岁承宗作《三十五忠诗》，记念死难的东林党人。王在晋上疏诬告承宗，承宗被迫上疏为本身白冤。四月，崇祯天子起用袁崇焕为蓟辽督师。袁崇焕在平台召对时承诺五年复辽。

万历二十一年（年），孙承宗到běi ī，入国子监读书；次年落第人。厥后，因房守士升任大同巡抚，孙承宗随行。大同是当时明朝的边城重镇，承宗边疆教书时，对军事有着稠密兴趣。“杖剑游塞下，从飞狐（河北涞源北飞狐关）、拒马间直走白登（山西大同东）。又从纥干（山西大同东纥真山）、青波（河北清河）故道南下，笼络其豪杰，与戍将老卒，周行边垒，拜候关键阨塞，相与解裘马，贳酒高歌。用是以晓畅虏情，告诉边事本末”。

一时，明廷乱作一团。而袁崇焕也因为擅自媾和、擅杀大将等罪名被下狱。在此危难之际，承宗力保祖大寿，明廷亦再次起用孙承宗，“诏以原官兼兵部尚书守通州”，兼顾全局。孙承宗起首晓以大义，安宁了军心。厥后调和各路军队，结合行动，经数月艰苦作战，获得“遵永大捷”，并于崇祯三年（）蒲月将后金军摈除出关。