唐生智遂即出示蒋介石命的电令：“电文说‘如环境不能耐久时，可相机撤退，以图清算而期反攻。’据此，我和罗卓英、刘兴两副司令长官及周参谋长研讨，决定于12日夜开端撤退。上面，由周参谋长分发撤退号令和突围打算。”

12日晚，叶肇及邓龙光两军长商定：第66军和第83军不履行保护任务，两军由叶肇同一批示从正面突围，向指定地点转进。当即号令各师“按第160师、159师、156师、154师之挨次，由承平门突围，经汤山、句容向安徽宁国集合。”

周斓把撤退号令和计分别发给各将领后，夸大说：“都城卫戍军队决于本日（12日）晚，突破劈面之敌，向浙、皖边区转进。各军队行动时候、颠末地区及集结地区，如计划规定。各军队官兵应照顾四天炒米及食盐。”

13日上午，日军各军队别离由中庙门、光彩门、中华门、水西门等处进入南都城内。山田支队占据了南京最后一个支撑点幕府山；天谷支队度太长江占据扬州，堵截了大运河；第6师团一部进至下关；国崎支队占据浦口，堵截了南京守军统统退路。堆积于燕子矶、下关沿江一带及八卦洲、江心洲中，未撤至江北的多量中国官兵成为战俘。已渡至江北的中**队沿津浦路向徐州方向撤退。

20日前后，各师大部别离达到南陵、歙县。第66军参谋处长郭永镳在九龙山一带收留失散官兵1,300余人，临时编为三个营，而后归队。未接到号令的第156师与教诲总队一同撤至下关，部分官兵度太长江展转归队。第74军构造较好，又把握有一艘小火轮，约有五千人度过江北。其他军队连夜抢渡，直至天亮不断。

城内各军队多沿中山路向下关撤退，而挹江门摆布两门洞已经堵塞，仅中间一门能够通行，各部抢先抢过，互不相让，很多人因挤倒而被踩死。如教诲总队第1旅第2团团长谢承瑞，在光彩门阵地曾英勇地击退日军多次打击，却被拥堵人群踩死在挹江门门洞里。

唐生智最后宣布：“撤退的原则是：雄师队从正面突围，由第66军和83军保护；第87师、第88师、第36师和教诲总队，随司令部由下关渡江，由第36师保护。会后当即行动。”

12日晚，卫戍司令长官唐生智、副司令长官罗卓英、刘兴及长官部官兵，从下关煤炭港乘预备的小火轮渡江至浦口，获得日军已至江浦四周、正向浦口包抄的谍报，遂徒步向扬州顾祝同第三战区司令部挨近；13日7时到扬州时，顾祝同及战区司令部已移驻临淮关，临行时留下六辆卡车。唐生智等首要官员及卫队乘汽车至滁州转火车，于当夜达光临淮关。

12月12日晚，唐生智召开师以大将体味议，安插撤退行动。唐生智起首扼要申明当前战况，扣问大师是否还能持续死守？众将领沉默无语。